1.蛋白质精氨酸甲基转移酶AtPRMT6的功能研究。负责人：董玉柱，中科院植物所。研究期限：2009年1-12月。

2.大豆抗SMV基因的定位。负责人：喻德跃，南京农业大学国家大豆改良中心。研究期限：2009年1-12月。

3.水稻减数分裂相关基因Os SMC3的克隆与功能研究。负责人：于恒秀，扬州大学农学院。研究期限：2009年1-12月。

4.利用谷子重组自交系定位控制穗部性状的重要基因。负责人：智慧，中国农科院作物所。研究期限：2009年1-12月。

5.植物ERAD的机制和功能。负责人：阳成伟，华南师范大学生命科学院。研究期限：2009年1-12月。

6.纳米碳促进植物生长的作用机理。负责人：刘键，华农肥料技术有限公司。研究期限：2009年1-12月。

7.水稻先天免疫反应与OsNOA1基因表达调控的相关性研究。负责人：陶跃之，浙江省农科院。研究期限：2009年1-12月。

8.利用转录后基因沉默策略实现抗马铃薯类病毒的研究。负责人：吕典秋，黑龙江省农科院农业部马铃薯种薯质量检测中心。研究期限：2009年1-12月。

9.棉花黄萎病抗性的蛋白质组学研究。负责人：马银平，山东农业大学。研究期限：2009年1-12月。