1.  水稻MSH4及MSH5参与同源染色体重组的分子机理。负责人：罗琼，云南农业大学

2.  东北粳稻重要农艺性状的分子改良。负责人：王连敏，黑龙江省农科院栽培所

3.  植物天然免疫网络模型的构建。负责人：李燕，四川农业大学

4.  植物高效无选择标记系统的优化与应用研究。负责人：来永才，黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所

5.  蔷薇属LEAFY同源基因的克隆与功能鉴定。负责人：刘青林，中国农业大学生物技术学院

6.  抗黄萎病转基因植物的获得。负责人：高峰，石河子大学

7.  利用海岛棉染色体片段导入系培育抗黄萎病棉花新种质。负责人：孙杰，石河子大学

8.  木薯细菌性萎蔫病菌致病相关基因的克隆与鉴定。负责人：时涛，中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

9.  植物中蛋白质精细调控体系的建立。负责人：路铁刚，中国农业科学院生物技术研究所

10.新型转基因抗虫棉花的培育。负责人：彭清忠，吉首大学